Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HRCP23327 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HRCP23327 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HRCP23327 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HRCP23327 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HRCP23327 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HRCP23327 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HRCP23327 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HRCP23327 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HRCP23327 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HRCP23327 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HRCP23327 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HRCP23327 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HRCP23327 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HRCP23327 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HRCP23327 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HRCP23327 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HRCP23327 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HRCP23327 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HRCP23327 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HRCP23327 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HRCP23327 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms