Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK4P11802 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK4P11802 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK4P11802 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK4P11802 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK4P11802 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK4P11802 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK4P11802 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK4P11802 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK4P11802 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK4P11802 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK4P11802 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK4P11802 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK4P11802 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms