Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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