Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM149AA5PLN7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms