Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSDA5PKW4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms