Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN16Q9Y5I7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN16Q9Y5I7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN16Q9Y5I7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN16Q9Y5I7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms