Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCAF1Q9Y4C2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCAF1Q9Y4C2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCAF1Q9Y4C2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCAF1Q9Y4C2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCAF1Q9Y4C2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCAF1Q9Y4C2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCAF1Q9Y4C2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCAF1Q9Y4C2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCAF1Q9Y4C2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCAF1Q9Y4C2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCAF1Q9Y4C2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCAF1Q9Y4C2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCAF1Q9Y4C2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCAF1Q9Y4C2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCAF1Q9Y4C2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCAF1Q9Y4C2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCAF1Q9Y4C2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCAF1Q9Y4C2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 517.1 ms