Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHTOPQ9Y3Y2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms