Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HDGFL3Q9Y3E1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HDGFL3Q9Y3E1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms