Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED7Q9Y3B3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TMED7Q9Y3B3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED7Q9Y3B3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms