Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M2

SSUH2, Protein SSUH2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSUH2Q9Y2M2 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSUH2Q9Y2M2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSUH2Q9Y2M2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSUH2Q9Y2M2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSUH2Q9Y2M2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSUH2Q9Y2M2 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSUH2Q9Y2M2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSUH2Q9Y2M2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSUH2Q9Y2M2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSUH2Q9Y2M2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSUH2Q9Y2M2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSUH2Q9Y2M2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSUH2Q9Y2M2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SSUH2Q9Y2M2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSUH2Q9Y2M2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSUH2Q9Y2M2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSUH2Q9Y2M2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSUH2Q9Y2M2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSUH2Q9Y2M2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSUH2Q9Y2M2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSUH2Q9Y2M2 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSUH2Q9Y2M2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms