Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SIK3Q9Y2K2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK3Q9Y2K2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK3Q9Y2K2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms