Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2A9

B3GNT3, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT3Q9Y2A9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3GNT3Q9Y2A9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
B3GNT3Q9Y2A9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B3GNT3Q9Y2A9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B3GNT3Q9Y2A9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
B3GNT3Q9Y2A9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B3GNT3Q9Y2A9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B3GNT3Q9Y2A9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B3GNT3Q9Y2A9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B3GNT3Q9Y2A9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B3GNT3Q9Y2A9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B3GNT3Q9Y2A9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B3GNT3Q9Y2A9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B3GNT3Q9Y2A9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms