Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BTRCQ9Y297 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BTRCQ9Y297 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms