Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HPSEQ9Y251 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPSEQ9Y251 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPSEQ9Y251 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms