Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF3IP3Q9Y228 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAF3IP3Q9Y228 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms