Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVW-1Q9UQF0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVW-1Q9UQF0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms