Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEU3Q9UQ49 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEU3Q9UQ49 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEU3Q9UQ49 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEU3Q9UQ49 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEU3Q9UQ49 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEU3Q9UQ49 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEU3Q9UQ49 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEU3Q9UQ49 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEU3Q9UQ49 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms