Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLEC4EQ9ULY5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC4EQ9ULY5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLEC4EQ9ULY5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLEC4EQ9ULY5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC4EQ9ULY5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC4EQ9ULY5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC4EQ9ULY5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC4EQ9ULY5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC4EQ9ULY5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC4EQ9ULY5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC4EQ9ULY5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC4EQ9ULY5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC4EQ9ULY5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC4EQ9ULY5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC4EQ9ULY5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC4EQ9ULY5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC4EQ9ULY5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC4EQ9ULY5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC4EQ9ULY5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC4EQ9ULY5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms