Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULX5

RNF112, RING finger protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF112Q9ULX5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF112Q9ULX5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF112Q9ULX5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF112Q9ULX5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF112Q9ULX5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF112Q9ULX5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF112Q9ULX5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF112Q9ULX5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF112Q9ULX5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF112Q9ULX5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF112Q9ULX5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF112Q9ULX5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF112Q9ULX5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF112Q9ULX5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF112Q9ULX5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF112Q9ULX5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF112Q9ULX5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF112Q9ULX5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms