Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDRG4Q9ULP0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDRG4Q9ULP0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDRG4Q9ULP0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms