Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX7

NUP50, Nuclear pore complex protein Nup50, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50Q9UKX7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP50Q9UKX7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP50Q9UKX7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms