Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMFRQ9UKV5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms