Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJD2Q9UKL4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
GJD2Q9UKL4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 314.2 ms