Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CHIC2Q9UKJ5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CHIC2Q9UKJ5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CHIC2Q9UKJ5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CHIC2Q9UKJ5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CHIC2Q9UKJ5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CHIC2Q9UKJ5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CHIC2Q9UKJ5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CHIC2Q9UKJ5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CHIC2Q9UKJ5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHIC2Q9UKJ5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms