Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ3

GPATCH8, G patch domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH8Q9UKJ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GPATCH8Q9UKJ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GPATCH8Q9UKJ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
GPATCH8Q9UKJ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
GPATCH8Q9UKJ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
GPATCH8Q9UKJ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
GPATCH8Q9UKJ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
GPATCH8Q9UKJ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
GPATCH8Q9UKJ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
GPATCH8Q9UKJ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms