Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMEB2Q9UKD1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GMEB2Q9UKD1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms