Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MID2Q9UJV3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MID2Q9UJV3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MID2Q9UJV3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MID2Q9UJV3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MID2Q9UJV3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MID2Q9UJV3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MID2Q9UJV3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MID2Q9UJV3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MID2Q9UJV3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MID2Q9UJV3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MID2Q9UJV3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MID2Q9UJV3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MID2Q9UJV3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MID2Q9UJV3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MID2Q9UJV3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MID2Q9UJV3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MID2Q9UJV3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MID2Q9UJV3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MID2Q9UJV3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MID2Q9UJV3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms