Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBD1Q9UJT1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBD1Q9UJT1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms