Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CTNNA3Q9UI47 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTNNA3Q9UI47 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNA3Q9UI47 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms