Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRPS1Q9UHF7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPS1Q9UHF7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms