Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL3Q9UH77 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL3Q9UH77 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms