Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUX4Q9UBX2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUX4Q9UBX2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.2 ms