Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HDAC6Q9UBN7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC6Q9UBN7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms