Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNG4Q9UBN1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CACNG4Q9UBN1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNG4Q9UBN1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNG4Q9UBN1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNG4Q9UBN1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG4Q9UBN1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG4Q9UBN1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG4Q9UBN1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG4Q9UBN1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG4Q9UBN1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG4Q9UBN1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms