Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPRR3Q9UBC9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPRR3Q9UBC9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPRR3Q9UBC9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPRR3Q9UBC9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPRR3Q9UBC9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPRR3Q9UBC9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPRR3Q9UBC9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPRR3Q9UBC9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms