Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNMT3BQ9UBC3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT3BQ9UBC3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms