Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC1

NFKBIL1, NF-kappa-B inhibitor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIL1Q9UBC1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKBIL1Q9UBC1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIL1Q9UBC1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIL1Q9UBC1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.1 ms