Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LRP2BPQ9P2M1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRP2BPQ9P2M1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRP2BPQ9P2M1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms