Protein–RNA interactions for Protein: Q9P283

SEMA5B, Semaphorin-5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5BQ9P283 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA5BQ9P283 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA5BQ9P283 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms