Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PHRF1Q9P1Y6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PHRF1Q9P1Y6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
PHRF1Q9P1Y6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PHRF1Q9P1Y6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms