Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMOD2Q9NZR1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMOD2Q9NZR1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMOD2Q9NZR1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms