Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD3Q9NZN3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms