Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MCM9Q9NXL9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCM9Q9NXL9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms