Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMPD4Q9NXE4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPD4Q9NXE4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms