Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
SLC52A1Q9NWF4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SLC52A1Q9NWF4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SLC52A1Q9NWF4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SLC52A1Q9NWF4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms