Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCF3Q9NUQ8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCF3Q9NUQ8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCF3Q9NUQ8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms