Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD9

PIGV, GPI mannosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGVQ9NUD9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PIGVQ9NUD9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIGVQ9NUD9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PIGVQ9NUD9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms