Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A11Q9NSA0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms