Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLE3Q9NRF9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLE3Q9NRF9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLE3Q9NRF9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms